电子行程单可以作为报销凭证。

根据相关规定：航空运输电子客票暂使用《航空运输电子客票行程单》作为旅客购买电子客票的付款凭证或报销凭证；同时具备提示旅客行程的作用。

《行程单》采用一人一票，不作为机场办理乘机手续和安全检查的必要凭证使用。

因此，电子行程单是可以作为报销凭证的。