新制度下，非财政补助结余是指事业单位除财政补助收支以外的各非专项资金收入与各非专项资金支出相抵后的余额。“非财政补助结余分配”科目则用于核算事业单位本年度非财政补助结余分配的情况和结果。年末，将“事业结余”科目余额和“经营结余”科目贷方余额结转至“非财政补助结余分配”科目后，要按照规定进行结余分配。