税局代增值税专用发票已作废正常不需要做账务处理，如果税款已经缴纳的话，那先入账，后期申请退税。

借：应交税费-应交增值税，

借：应交税费-城建税，

贷：银行存款，

收到退税款的时候，

借：应交税费-应交增值税借方红字，

借：应交税费-城建税借方红字，

借：银行存款 借方蓝字。