可以抵扣进项税额的发票有：增值税专用发票，海关进口增值税专用缴款书，运输业增值税专用发票，农产品收购发票等。可以抵扣的进项税额包括：一般纳税人发生的与生产经营有关的进项税额是可以按规定进行认证抵扣的。