企业转让无形资产使用权计入的科目需要根据企业的主营业务来判断，如果企业主营业务就是转让无形资产的使用权，则计入到主营业务收入科目，如果企业主营业务并不是这个，而是其他的项目，只是偶尔发生类似的业务，可以计入到其他业务收入科目。