总公司的合同分公司开票和收款是不合理的，合同名字，付款单位和发票开具单位三者一致才好避免税务风险，如果与总公司签订的合同上有一条上写明了由分公司开发票并收款，总公司也写了授权委托，委托分公司给对方开发票和收款的话，虽然不提倡这种做法，但是如果当地税务机关默许的话，也是可以的。