补缴个人社保部分可以在当月工资中扣除后缴纳个人所得税。《个人所得税法实施条例》1653第二十五条，按照国家规定，单位为个人缴付和个人缴付的基本养老保险费、基本医疗保险费、失业保险费、住房公积金，从纳税义务人的应纳税所得额中扣除。