一般情况下所谓的损失补偿是经过协商后签过协议和通过银行转帐结算，可以不用开发票；如果损失的是商品，双方都是增值税一般纳税人，就需要开具增值税专用发票或由收款方到当地税务机关出具红字发票开票证明后由销货方开具增值税专用发票进行冲红，并退款给损失方。