零余额账户可以分为财政部门的零余额账户和预算单位（行政事业单位）的零余额账户，财政部门的零余额账户在财政国库会计中使用（用于财政直接支付和与国库单一账户支出清算），行政事业单位使用预算单位的零余额账户（用于财政授权支付和清算）。预算会计零余额账户需清零，所以没有余额。