在两家公司领工资各自记账各自申报，年度终了后个人所得税汇算清缴。

个人在中国境内取得两处及以上工资、薪金所得，由扣缴单位各自完成扣缴申报，基本减除费用以及社保公积金专项扣除费用，只能选择一个扣缴单位减除。