企业购买原材料款项未支付的款项应该计入“应付账款”科目核算。其会计分录如下：

原材料入库，未支付货款，其会计分录：

借：原材料，

应缴税费—应交增值税（进项税额），

贷：应付账款—某公司。

结清货款，其会计分录：

借：应付账款—某公司，

贷：银行存款。