供应商专用发票多开了，优先是跟供应商协商进行发退票处理，让供应商重新开具新的发票。这张多开的发票进行作废处理。如果实在是无法作废或退回，那也可以直接用这张发票入账，不过金额要用正确的。抵扣时也只能抵扣相应的正确进项税额。