三代手续费是指代扣代缴、代收代缴和代征税款的手续费。是国家为调动相关税种的扣缴义务人、代征单位和个人的积极性，每年在一定时间按其实际代扣代缴、代收代缴和代征税款的一定比例返还给这些单位和人员的费用，简称“三代手续费”。最常见的比如，单位每月发放工资时代员工扣缴的个人所得税，可以按实际缴纳入库金额向税局申请按2%比例返还。