纳税年度内预缴税额低于应纳税额，是很正常的情况。如果是企业所得税，预缴就是你季度报缴纳的金额，应纳税额是汇算清缴之后按税法规定的需要缴纳的金额。比如应纳税额是100万，预交只有90万，那预交就低于了应纳税额的。