一般预收工程款你们按收款收据或银行回单入账就可以了，或是开具62不征税发票。这样就可以做：

借：银行存款，

贷：预收账款-明细。

国家税务总局公告2016年第53号 国家税务总局关于营改增试点若干征管问题的公告 纳税人收取款项但未发生销售货物、应税劳务、服务、无形资产或不动产时，使用“未发生销售行为的不征税项目”编码，发票税率栏应填写“不征税。