增值税电子普通发票不能直接进行作废处理。增值税电子普通发票开具后，如发生开票有误、销货退回或销售折让等应开具红字增值税电子普通发票，无需退回增值税电子普通发票。主要理由是：由于增值税电子普通发票具有可复制性，无法回收的特点，因此增值税电子普通发票一旦开具暂不能作废。