在实务中，对于使用支付宝发生的手续费，一般计入企业的财务费用。

在销售收款时：

借：银行存款 财务费用-手续费，

贷：应收账款。

在采购付款时，如果需要企业负担手续费：

借：原材料/库存商品 应交税费-应交增值税（进项税额）财务费用-手续费，

贷：应付账款。